امروزه در بسیاری‌از نقاط جهان‌بیماریهای‌مسری‌مشکلات‌بسیاری‌را برای‌جوامع‌انسانی‌به‌وجودمی‌آورد; این‌درحالی‌است‌که‌آسیب‌ها‌وخسارات‌ناشی‌از این‌بیماریها کشورهای‌در حال‌توسعه‌را در مقایسه‌باکشورهای‌صنعتی‌بیشتر تحت‌تأثیر قرار می‌دهد. در این‌میان‌بیماریهای‌انگلی‌با انتشاری‌گسترده‌به‌عللی‌از قبیل‌فقر،سؤ تغذیه، بی‌سوادی، و ازدیادبی‌رویه‌جمعیت، فقدان‌تسهیلات‌بهداشتی‌ودهها عامل‌دیگر بخش‌عمده‌ای‌ازمشکلات‌را به‌خود اختصاص‌می‌دهد، به‌گونه‌ای که در برخی از مناطق‌جهان‌سهم‌بیماریهای انگلی‌در ایجاد خسارات‌اجتماعی، اقتصادی‌با برخی‌بیماریهانظیرسل،بیماریهای‌مقاربتی، بیماریهای‌قابل‌پیشگیری‌با واکسن‌وعفونتهای‌حادّ تنفسی‌برابری‌می‌کند. عمده داروهای مورد استفاده در این بیماریها در دسته داروئی بنزیمیدازول ها قرار می گیرد و ما در این پروژه این دسته داروئی را مورد بررسی قرار می دهیم. مشکل عمده ای که این داروها(آلبندازول و ترکیبات مشا به آ ن) دارندبه راحتی از سد خونی مغزی عبور نمی کنند و ما به دنبال روشی برای حل مشکلات این داروها بدون ورود به آزمایشگاه و صرف وقت و هزینه می باشیم. شیمی محاسباتی بخصوص محاسبات کوانتوم مکانیکی رویکرد نوینی به پدیدههای شناخته شده و آشنای فیزیکی و شیمیایی است که میتواند منجر به درک بهتر جهان پیرامون ما گردد. امروزه با پیشرفت روز افزون کامپیوترها قادر هستیم پدیدههای گوناگون را در ماتریسهای بسیار پیچیده نظیر سیستمهای بیولوژیکی و نانوتکنولوژی مورد مطالعه قرار دهیم و بدیهی است که انجام چنین مطالعاتی در درجه اول نیازمند درک وسیعی از پدیدههای فیزیکی و شیمیایی، ابداع و نوآوری روشهای نوین مطالعاتی و تجزیه و تحلیل مستند و هدفدار است. یکی از زمینه های مهم کاربرد کمومتریکس در مطالعاتی است که خواص مولکولها را به ویژگی های ساختاری آنها نسبت می دهد. ازنظر شیمی دانان فعالیت و خواص یک ترکیب ناشی از ویژگی های ساختاری آن است. این نوع از مطالعات به بررسی کمی ارتباط ساختمان با فعالیت،QSAR ، و همچنین بررسی کمی ارتباط ساختمان با ویژگی، QSPR، معروف می باشد.پس ما فاکتور مهمی که در این پروژه مورد بررسی قرار می دهیم، ضریب توزیع دارو در فاز آلی(1- اکتانول) نسبت به فاز آبی(آب) می باشد، ما در این پروژه از دو متد HF,DFT وسری پایه 6-31+G** وبا استفاده از رگرسیون خطی چندگانه به ارائه مدلی که ضریب توزیع دارو را بهبود ببخشد، به نتایج بسیار خوبی رسیدیم که نشان دهنده بهتر شدن این فاکتور داروئی(ضریب توزیع) می باشد.
شامل بخشهای:
فصل اول:
فصل دوم
2-1-تاریخچه کوتاهی از کامپیوترها 8
2-3- کاربرد علمی کامپیوتر ها 11
2-3-1- مدل سازی،بهینه سازی و شبیه سازی.. 11
2-3-2- مدیریت و کنترل آزمایش ها 11
2-3-4- بهینه سازی سادک/روش سادک.. 13
2-3-5- نمایش گرافیکی مولکولها 13
فصل سوم
3-2- روش محاسباتی مکانیک کوانتومی)ساختار الکترونی) 21
3-2-2- روشهای محاسباتی نیمه تجربی. 28
3-2-3- روشهای عملی دانسیته: 29
فصل چهارم
4-1- انتخاب و محاسبه توصیف کننده ها 36
4-1-1- توصیف کنندهای توپولوژیکی. 38
4-1-1-1- توصیف کننده های جزء. 39
4-1-1-2- اندیس های ارتباطی مولکول. 39
4-1-1-3- توصیف کننده های زیر ساختاری.. 40
4-1-1-4- توصیف کننده های محیطی. 40
4-1-2- توصیف کنندهای هندسی. 40
4-1-2-2-1- توصیف کننده های مساحت سایه مولکول. 42
4-1-2-2-2- توصیف کننده های اندیس کاپا 42
4-1-2-2-3- توصیف کننده های فاکتور شکل. 42
4-1-2-2-4- توصیف کننده های مساحت و حجم واندروالس مولکول ها 43
4-1-2-2-5- توصیف کننده های محورهای اصلی چرخش مولکول ها: 43
4-1-2-2-6- توصیف کننده های ممان اینرسی اصلی مولکول ها: 44
4-1-3- توصیف کننده های الکترونی. 44
4-1-4- توصیف کنند ه های فیزیکوشیمیایی. 45
4-1-4-2- لگاریتم ضریب تقسیم 46
4-1-4-3- قطبش پذیری ملکولی. 47
4-1-5- توصیف کننده های هیبریدی.. 47
4-1-6- توصیف‌کننده‌های شیمی کوانتومی. 47
4-1-7- توصیف‌کننده‌های ارتباطی مولکولی. 48
4-3- ارزیابی اعتبار مدل‌های انتخاب شده 49
4-5- برخی از محدودیتها و اشکالات QSAR.. 55
فصل پنجم
5-2-1- Chemdraw Activex 8.0. 60
فصل ششم
6-2- فناوری نانودردارورسانی. 67
6-6- سیستمهای نوین دارو رسانی: 69
6-7-2- ریوی/ تنفسی (از طریق شش‌ها): 72
6-7-3- مهپاش‌ها ـ از طریق بینی: 72
6-7-4- تزریق درون ماهیچه‌ای: 73
6-7-5- سیستمهای قابل کاشت / سیستمهای پلیمری قابل تزریق: 73
6-8- دیگر سیستمهای دارورسانی. 74
6-8-2- فلورن ها ( Fullerenes ) 75
6-8-3- سیستمهای دارورسانی لیپوزومی. 76
6-8-4- سیستمهای تزریق ناگهانی. 76
6-8-10- کوبوزوم‌ها و هگزوزوم‌ها 78
6-9-1- کاربرد های نانو ذرات: 79
6-9-3- اثرات مضر بر سلامتی. 80
6-9-4- برخی راههای کنترل اثرات مضر نانوذرات: 81
6-12- به دام انداختن دارو به وسیله‌ی ذره 83
6-13- مسائل عمده دارورسانی. 83
6-14- پلی‌لاکتیک‌گلایکولیک‌اسید (PLGA) و پلی‌اتیلن‌گلایکول(PEG) 84
فصل هفتم
7 -2-2-1- توصیفگرهای شیمی کوانتومی. 91
7-2-2-1-2- پارامترهای ایزوتوروپیک... 91
7-2-2-1-3- انرژی آزاد حلال(اکتانول-آب) 92
7-2-2-1-4- گشتاور دو قطبی مولکول. 92
7-2-2-1-5- قطبش پذیری مولکولی. 92
7-2-2-1-6-آنالیز جمعیت طبیعی (NPA) 93
7-2-2-1-7-بالاترین تراز اوربیتال مولکولی اشغال شده 93
7-2-2-1-8- پائین ترین تراز اوربیتال مولکولی اشغال نشده 93
7-2-2-1-9- اختلاف بین تراز اوربیتال مولکولی اشغال شده واشغال نشده 93
7-2-2-1-10- پتانسیل الکترواستاتیک... 93
7-2-2-1-12- الکترونگاتیوی.. 94
6-2-2-2- توصیف کننده های فیزیکو شیمیایی. 95
7-2-4-3-تست اعتبار سنجی(Cross validation Test) 100
7-3-محاسبه ی Logp با استفاده از محاسبات ترمو دینامیکی: 101
7-4-1-چگونگی رسم و اپتیمایز ساختارها : 101
7-4-3 :اتصال حامل به دارو و بهینه سازی کمپلکس ایجاد شده: 103
فصل هشتم
شامل 133 صفحه فایل word قابل ویرایش
دانلود تحقیق شیمی محاسباتی